El inicio

Empieza a jugar en la cantera del Rosario Central desde muy pequeño. Su clase y temperamento no pasan desapercibidos en Argentina y Matías es fijo de todas las selecciones inferiores de su país.

En 2001 aparece la gran ocasión de fichar con el River Plate. En 2003 ateriza en Europa con la camiseta del Atlético de Madrid (34 partidos, 2 goles) en préstamo, donde sigue mostrando su poder. Pero no le basta para que el Atlético lo fiche el año siguiente, porque César Ferrando, el entrenador de aquel periodo, pide a la directiva rojiblanca la contratación del defensa del Albacete y más adelante de la selección Pablo Ibáñez.
Muy dolido por esta decisión Lequi ficha por el Calcio italiano con la camiseta de la Lazio (6 partidos, 0 goles). Aquí su progreso se retrasa decisivamente, no obstante que el periódico de la capital italiana el día de su fichaje titula : Por fin, Lequi. Ni Caso ni Papadopulo, los dos entrenadores del año en la Lazio, lo hacen jugar con frecuencia. En enero aparece la posibilidad de irse al Levante UD pero Matias no acepta. En el último día para realizar contrataciones de jugadores de la temporada 2005/2006 el Celta lo ficha cedido con opción de compra. En dos meses se merece el puesto de titular en pared con Sergio de la zaga del Celta.
Durante la temporada 2006/2007 ha sido adquirido por el Celta de Vigo convirtiéndose en una de las resonantes contrataciones del club gallego para la temporada antes mencionada, firmando asi un contrato por 4 años con el club; convietiendose en uno de los mejores centrales y pieza indiscutible en la alineacion del Celta. Su carrera sigue en constante ascenso, pudiendo en cualquier momento ser convocado por el seleccionador de Argentina.